香港马会开奖搅珠现场集美貌与才华于一身这款

时间:2019-10-08

  你曾经为作图而苦恼吗?你曾经因为Figure丑而被导师嫌弃吗?你曾为高颜值的PPi图、火山图、热图、韦恩图,弦图和主成分分析图而折服吗?今天笔者给大介绍一款强大的在线作图神器——NetworkAnalyst,能够将你知道的高端大气上档次的图一网打尽。

  进入NetworkAnalyst网站,网址为在网页的上方有关于NetworkAnalyst网站的定义:它是一个基因表达和meta分析的可视化分析平台。可以看到,该网站由5个数据上传入口,可以根据不同的需求进行选择,今天笔者以Multiple Gene ExpressionTables入口为例给大家讲解。

  需要上传数据时,点击“Upload”即可上传,这里我以网站自带的数据为例进行上传。点击“Try our example”,获取三个数据集,香港马会开奖搅珠现场分别为“E-GEOD-25713、E-GEOD-59276和GSE69588”。

  点击“OK”即可完成上传,网站对各个数据分别进行了ID转换、注释、标准化以及可视化等多项操作。

  点击“Visualization”栏目下方的“view”,可以看到该数据集分析后的箱式图和主成分分析(PCA)图。

  在图4网页的下端,点击“Proceed”,随后在新出现的网页中选择“Next”对这三个数据集进行处理。在质量检测(quality check)页面中,可以看到这三个数据集的PCA图和密度图。

  点击“Proceed”继续处理,在新的网页中点击“submit”,“Proceed”。可以看到各个基因在三个数据集中的变化。

  点击网页下方的“Proceed”,随后可以选择不同的展现方式对数据进行可视化。

  点击“Generic PPI”,随后需要选择构建蛋白相互作用网络的数据库,这里我选择应用较多的STRING数据库。

  点击“ok”,随后选择“Proceed”继续处理数据,就可以获得如下图的PPI网络图。在该页面中,可以对PPI图进行各种调整,包括背景颜色、可视化图形、布局和边缘类型。

  点击“ORA Enrichment”,可以获得如下图所示的ORA富集图,与PPI图类似也可以对图形进行修改。

  点击“ORA Heatmap Clustering”,在数据集选择页面中点击“ok”即可获得如下图ORA热图。

  点击“Venn Diagram”,“ok”,随后可以获得如下韦恩图。点击韦恩图中的任意区域,可以在左边看到交集中的基因。

  点击“Chord Diagram”,由于弦图在基因超过1000个时无法展示,而且需要两个数据集,因此我们选择的这三个数据集无法得出弦图。

  只需要你准备原始的测序数据,该在线网站可以实现一键分析,而且可以进行多种高颜值图形的可视化。各位科研同伴们,可以试试这个网站啊,保证你爱不释手。


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